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Programas PCR
Uso de un programa PCR precargado
Uso de un programa PCR precargado
En el software ya vienen cargados varios programas PCR para su uso en
SureCycler 8800 de 96 pocillos. Estos programas están diseñados para realizar
PCR con una variedad de kits y enzimas PCR de Agilent y así amplificar el
ADN vector o genómico humano.
Cada programa precargado está optimizado para amplificar objetivos de una
longitud específica con una temperatura de hibridación adecuada para
algunos cebadores. Puede que deba ajustar la temperatura de hibridación, el
tiempo de extensión u otro parámetro de termociclado utilizado en el
programa precargado para adaptarse mejor a su objetivo de interés específico.
Cualquiera de los programas precargados puede guardarse con un nuevo
nombre de archivo y seguidamente modificarse para optimizar el programa
respecto a su sistema de cebador/molde.
En la
Tabla 5
Descripción de los programas PCR precargados para SureCycler 8800 de 96 pocillos
Nombre de archivo del
programa PCR
Herculase II Fusion 1kb target.pcr
Paq5000 HS MM 1kb target.pcr
PfuTurbo HS MM 1kb target.pcr
PfuUltra II HS MM 1kb target.pcr
QuikChange II 4 kb target.pcr
QuikChange Lightning 4kb
target.pcr
QuikChange Lighting Multi 4 kb
target.pcr
QuikChange Multi 4kb target.pcr
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Tabla 5
se muestran los programas precargados disponibles.
Kit o enzima PCR
ADN polimerasa de fusión Herculase II 95°C durante
Mezcla maestra de inicio en caliente
Paq5000
Mezcla maestra de inicio en caliente
PfuTurbo
Mezcla maestra de inicio en caliente
PfuUltra II
Kit de mutagénesis dirigida
QuikChange II
Kit de mutagénesis relámpago
dirigida QuikChange
Kit de mutagénesis relámpago
multidirigida QuikChange
Kit de mutagénesis multidirigida
QuikChange
Desnaturaliz
ación
20 segundos
95°C durante
20 segundos
95°C durante
30 segundos
95°C durante
20 segundos
95°C durante
30 segundos
95°C durante
20 segundos
95°C durante
20 segundos
95°C durante
1 minuto
Guía de configuración y uso de Agilent SureCycler 8800
Hibridación
Extensión
55°C durante
72°C durante
20 segundos
30 segundos
55°C durante
72°C durante
20 segundos
30 segundos
55°C durante
72°C durante
30 segundos
1 minuto
55°C durante
72°C durante
20 segundos
15 segundos
55°C durante
68°C durante
1 minuto
4 minutos
60°C durante
68°C durante
10 segundos
2 minutos
55°C durante
65°C durante
30 segundos
2 minutos
55°C durante
65°C durante
1 minuto
8 minutos