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Apéndice B Análisis en tiempo real
Descripción general de Análisis en tiempo real
Flujo de trabajo de análisis en tiempo real
Supervisión de métricas de experimento
Descripción general de Análisis en tiempo real
El análisis en tiempo real (RTA) se ejecuta en el ordenador del instrumento, en el que realiza la llamada de
bases y asigna una puntuación de calidad a cada llamada de bases.
El software realiza un seguimiento del estado de cada placa y determina cuándo se debe avanzar al
siguiente paso del proceso. Al avanzar una placa, RTA produce un archivo para el paso finalizado y, a
continuación, inicia el paso siguiente. Por lo tanto, el software puede determinar el estado de cada placa en
función de los archivos existentes. Si finaliza RTA, guarda los datos del experimento y puede reanudar el
procesamiento.
Archivos de entrada
RTA precisa los archivos de entrada siguientes:
Archivos de intensidad de grupos, que contienen resultados de análisis de imágenes.
u
RunInfo.xml, que es un archivo que genera automáticamente el software de control al inicio del
u
experimento. A partir de este archivo, RTA lee el nombre del experimento, el número de ciclos, si una
lectura ha sido indexada y el número de placas de la celda de flujo.
HiSeq.Configuration.xml, que es un archivo de configuración del instrumento en formato XML.
u
RTA.exe.config, que es un archivo de configuración de software en formato XML.
u
RTA utiliza parámetros del experimento introducidos durante la configuración del experimento y recibe
comandos del software de control que incluyen información sobre el momento oportuno de inicialización y la
ubicación del archivo RunInfo.xml.
Archivos de resultados
Las placas son pequeñas áreas de adquisición de imágenes en la celda de flujo definidas como un campo
de visión por la cámara. Para cada placa que se analiza, RTA produce un conjunto de archivos de llamada
de base clasificada por calidad y archivos de filtro como resultado principal. Con otros archivos también se
pueden generar archivos de resultados elementales.
Archivos de llamadas de bases: Para cada placa que se analiza, se genera un archivo de llamadas de
u
bases (*.bcl) comprimido para cada placa por ciclo. El archivo de llamadas de bases contiene la llamada
de bases y la puntuación de calidad asociada.
Archivos de filtro: Cada placa produce información de filtro que se incluye en un archivo de filtro (*.filter)
u
para cada placa a lo largo de todo el experimento. El archivo de filtro determina si los grupos superan o
no el filtro.
Archivos de ubicación de grupos: Un archivo de ubicación de grupos (*.locs) contiene las coordenadas X
u
e Y para cada grupo de la celda de flujo.
Archivos de estadísticas: Se genera un archivo de estadísticas (*.stats) de cada ciclo. El archivo de
u
estadísticas contiene las estadísticas agregadas del ciclo.
N.º de documento 15011190 v02 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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