Supervisión De Métricas De Experimento - Illumina HiSeq 2000 Manual De Uso

Guía del sistema HiSeq 2000
Supervisión de métricas de experimento
RTA genera automáticamente criterios de medición de calidad cuando comienza el análisis de imágenes.
Sin embargo, no todos los criterios de medición están disponibles en los primeros ciclos porque algunos
procesos necesitan varios ciclos para poder generar datos.
Datos
Análisis de imágenes
Llamadas de bases
Cálculos de hebra
retrasada
Puntuaciones de
calidad
Índices de error
Controles en línea
Recuento de índices
* Sequencing Analysis Viewer (SAV) v1.8.44 y las versiones posteriores no incluyen la ficha TruSeq Controls (Controles de TruSeq), en la que el SAV
informa de los resultados del análisis de los controles en línea.
N.º de documento 15011190 v02 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Ciclo
Después del ciclo 5.
Durante los primeros cinco ciclos del experimento, RTA genera una plantilla de las
ubicaciones de los grupos.
Después del ciclo 12.
La llamada de bases comienza tras estimar la matriz de color en el ciclo 12.
Después del ciclo 25.
Las correcciones en la hebra retrasada para los 25 primeros ciclos determinan el cálculo
de la hebra retrasada.
Después del ciclo 25.
Se genera una puntuación de calidad para las lecturas que superan el filtro de calidad.
Dado que las puntuaciones de calidad requieren intensidades corregidas de futuros ciclos,
la puntuación de calidad siempre sigue a la llamada de bases.
Después del ciclo 25.
Los índices de error se generan solo cuando los grupos de PhiX están presentes y la
opción Align to PhiX (Alinear a PhiX) se ha seleccionado durante la configuración del
experimento.
En el ciclo 52 de cada lectura o al final del experimento en el caso de los experimentos
que cuentan con menos de 52 ciclos.
Los controles en línea se generan únicamente para los métodos de preparación de
bibliotecas de TruSeq.*
Después de que finalicen las lecturas de índices.
El recuento de índices por carril se genera cuando se ofrece una hoja de muestras.
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