Gestión De Errores; Flujo De Trabajo Del Análisis En Tiempo Real; Generación De Plantillas - Illumina NextSeq 550 Guía Del Sistema

Guía del sistema NextSeq 550
Los archivos de resultados se utilizan para los análisis sucesivos en BaseSpace. De manera alternativa, utilice
el software de conversión bcl2fastq para la conversión a FASTQ y soluciones de análisis de otros
proveedores. Para los archivos de NextSeq hace falta disponer de bcl2fastq v2.0 o posterior. Para obtener la
última versión de bcl2fastq, visite la
RTA v2 proporciona criterios de medición en tiempo real de experimentos de calidad guardados como
archivos InterOp. Los archivos InterOp son archivos de resultados binarios que contienen criterios de
medición relacionados con placas, ciclos y lecturas y son necesarios para la visualización de criterios de
medición en tiempo real con Sequencing Analysis Viewer (SAV). Para obtener la última versión de SAV, visite
la página de descargas del SAV
Gestión de errores
RTA2 crea archivos de registro y los guarda en la carpeta RTALogs (Registros de RTA). Los errores se
registran en un archivo de errores con formato *.tsv.
Los archivos de error y de registro siguientes se transfieren a la ubicación de destino de los resultados finales
tras completar el procesamiento:
*GlobalLog*.tsv contiene un resumen de los eventos importantes del experimento.
u
*LaneNLog*.tsv enumera los eventos de procesamiento de cada carril.
u
*Error*.tsv enumera los errores que se han producido durante un experimento.
u
*WarningLog*.tsv enumera las advertencias que se han producido durante un experimento.
u
Flujo de trabajo del análisis en tiempo real
Generación de plantillas
Registro y extracción de
intensidad
Corrección de hebra
retrasada
Llamada de bases
Puntuación de calidad
Generación de plantillas
El primer paso del flujo de trabajo de RTA es la generación de plantillas, que define la posición de cada grupo
en una placa mediante el uso de las coordenadas X e Y.
La generación de plantillas requiere datos de imagen de los primeros cinco ciclos del experimento. Tras el
último ciclo de la plantilla para la adquisición de imágenes de una placa, se genera la plantilla.
NOTA
Para detectar un grupo durante la generación de plantillas, debe haber como mínimo una base distinta de
G en los primeros cinco ciclos. Para las secuencias de índices, RTA v2 precisa como mínimo una base
distinta de G en los primeros dos ciclos.
Las plantillas se utilizan como referencia para el siguiente paso de registro y extracción de intensidad. Las
posiciones de los grupos para el conjunto de la celda de flujo se escriben en archivos de ubicación de grupos
(*.locs), uno para cada carril.
N.º de documento 15069765 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
página de descargas de NextSeq
en el sitio web de Illumina.
Sirve para asignar las ubicaciones de grupos.
Registra la ubicación de cada grupo en la celda de flujo y determina el valor de intensidad de
cada grupo.
Corrige los efectos de hebra retrasada y hebra adelantada.
Determina una llamada de bases para cada grupo.
Asigna una puntuación de calidad a cada llamada de bases.
en el sitio web de Illumina.
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