Registro Y Extracción De Intensidad; Corrección De Hebra Retrasada; Llamada De Bases - Illumina NextSeq 550 Guía Del Sistema

Guía del sistema NextSeq 550
Registro y extracción de intensidad
El registro y la extracción de intensidad comienza después de la generación de plantillas.
El registro alinea imágenes producidas durante cada ciclo de adquisición de imágenes posterior en
u
relación con la plantilla.
La extracción de intensidad determina un valor de intensidad para cada grupo de la plantilla para una
u
imagen determinada.
Si se produce un error en el registro de cualquier imagen en un ciclo, no se generará ninguna llamada de
bases para esa placa en ese ciclo. Utilice el software Sequencing Analysis Viewer (SAV) para examinar las
imágenes en miniatura e identificar las imágenes que no se han podido registrar.
Corrección de hebra retrasada
Durante la reacción de secuenciación, cada cadena de ADN de un grupo se amplía en una base por cada
ciclo. Las hebras retrasadas y hebras adelantadas se producen cuando una cadena queda fuera de su lugar
con respecto al ciclo de incorporación.
La hebra retrasada se produce cuando una base se atrasa.
u
La hebra adelantada se produce cuando una base se avanza.
u
Figura 30 Hebra retrasada y hebra adelantada
A Lectura con una base con hebra retrasada
B Lectura con una base con hebra adelantada
RTA2 corrige los efectos de la fase de hebra retrasada y de la fase de hebra adelantada, lo que aumenta al
máximo la calidad de los datos en cada uno de los ciclos del experimento.

Llamada de bases

La llamada de bases determina una base (A, C, G o T) para cada grupo de una placa determinada en un
ciclo específico. NextSeq 550 utiliza la secuenciación de dos canales, que precisa solo dos imágenes para
codificar los datos de cuatro bases de ADN: una del canal rojo y otra del canal verde.
Las intensidades extraídas de una imagen en comparación con otra imagen redundan en cuatro poblaciones
distintas, cada una de las cuales corresponde a un nucleótido. El proceso de llamada de bases determina a
qué población pertenece cada grupo.
N.º de documento 15069765 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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