Agilent G2565CA Guia Del Usuario página 54

Sistema de escáner de microarrays
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Modificación de los ajustes de barrido
(Ruta de salida)
(Descripción de
54
Guía del usuario del Sistema de scanner de microarrays Agilent G2565CA (Scan Control Software 8.5)
seleccionar el intervalo dinámico de archivos TIFF de 20 bits
para capturar el intervalo dinámico amplio de datos como
alternativa para utilizar XDR.
Con la función XDR activada, el scanner procesa automática-
mente la misma placa dos veces con dos niveles de sensibilidad
PMT diferentes. Esto genera que las dos imágenes vinculadas
que Feature Extraction puede procesar conjuntamente para
proporcionar un solo conjunto unificado de datos de intensidad
extraídos que abarcan hasta 6+ órdenes de magnitud.
El nivel de sensibilidad alta se ajusta mediante Red o Green
PMT Gain. La función XDR se desactiva automáticamente (una
vez activada) en valores por debajo del 10%.
Ajustar la columna de relación de XDR ordena al scanner que
realice un segundo barrido con ajustes de PMT más bajos. Por
ejemplo, si los PTM rojo y verde se ajustan al 100%, y la relación
de XDR se ajusta en 0,1, el segundo barrido se realizará con los
PMT ajustados al 10%. El ajuste de PMT más bajo disponible es
1%.
Output path
El botón Browse (Examinar) le permite seleccionar el directorio
en el que almacenar los datos desde cada barrido. Agilent reco-
mienda recopilar los datos en un directorio local en un disco
duro secundario. Es posible que también pueda seleccionar un
directorio de red. Si experimenta un problema de acceso a red
durante el barrido, los datos se guardarán en un directorio local
temporal, y se incluirá un mensaje de atención en el informe de
ejecución del carrusel.
Slide
Descripción de cada placa que se va a procesar. Esta
Description
información pasa a formar parte de la información del
archivo que se puede ver en el software Feature Extraction.
placa)

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