Tabla 11 Espacio de almacenamiento y tiempo de barrido
Resolución
Un solo paso de 2 micras
Un solo paso de 3 micras
Un solo paso de 5 micras
Un solo paso de 10 micras
Dos pasos de 2 micras
Dos pasos de 3 micras
Dos pasos de 5 micras
Alta sensibilidad de 2 micras 1300
Alta sensibilidad de 3 micras 620
Alta sensibilidad de 5 micras 200
Alta sensibilidad de 10 micras
Los barridos de dos pasos requieren el mismo espacio de almacenamiento que los barridos de un
solo paso, pero tardan el doble de tiempo en finalizar.
Red PMT
Ajusta el nivel de sensibilidad del PMT de canal rojo y de canal verde. El PMT detecta la
Sensitivity (%)
fluorescencia emitida por la microarray.
y
El nivel de salida predeterminado (100%) establece la ganancia al nivel calibrado de fábrica; éste
Green PMT
es el ajuste recomendado para microarrays Agilent. Puede reducir cada ajuste de canal de color
Sensitivity (%)
independientemente hasta un mínimo de 1%.
Si una microarray es tan brillante que se satura el extremo superior de la señal de salida, el nivel
de sensibilidad del PMT puede reducirse a un intervalo de sensibilidad que permita la lectura de
toda la información.
XDR Ratio
Antes de que el intervalo dinámico de TIFF de 20 bits estuviera disponible, se utilizaba la función
eXtended Dynamic Range en el escáner y en el programa Feature Extraction para capturar todos
los datos barridos entre características de señales muy bajas y características de señales muy
altas. Ahora, en lugar de utilizar XDR, puede seleccionar el intervalo dinámico de archivos TIFF
de 20 bits para capturar el intervalo dinámico amplio de datos.
N OTA
Con la función XDR activada, el escáner barre automáticamente la misma placa dos veces
con dos niveles de sensibilidad PMT diferentes. Genera dos imágenes vinculadas que Feature
Extraction procesa conjuntamente para proporcionar un solo conjunto unificado de datos
de intensidad extraídos. Estos datos abarcan hasta 6+ órdenes de magnitud.
El nivel de ganancia de PMT rojo o verde establece el nivel de sensibilidad alta. La función XDR
se desactiva automáticamente en valores por debajo del 10%.
Guía del usuario del Sistema SureScan
Espacio de
almacenamien
to, Mb, 16 bits
1300
620
200
52
1300
620
200
52
Si se selecciona la opción de 20 bits, no se permite la opción XDR.
Espacio de
Tiempo de
almacenamien
barrido, min.
to, Mb, 20 bits
1600
24
760
16
300
10
115
10
1600
46
760
31
300
19
1600
36
760
24
300
15
115
15
79