Introducir Parámetros Del Experimento - Illumina iSeq 100 Manual De Uso

Guía del sistema de secuenciación iSeq 100
Iniciar sesión en BaseSpace Sequence Hub
La pantalla de BaseSpace Sequence Hub aparece cuando el sistema se configura para la supervisión de un
experimento o el almacenamiento y la supervisión de un experimento.
1 Para desconectar el experimento actual de BaseSpace Sequence Hub, seleccione Skip BaseSpace
Sequence Hub Sign In (Omitir inicio de sesión en BaseSpace Sequence Hub).
Los datos de rendimiento del instrumento sí se envían a Illumina.
2 Para cambiar la conectividad del experimento actual, seleccione una opción de la configuración:
Run Monitoring (Solo supervisión del experimento): Envía solo los archivos InterOp a
u
BaseSpace Sequence Hub para permitir su supervisión remota.
Run Monitoring and Storage (Almacenamiento y supervisión de experimentos): Envía los datos del
u
experimento a BaseSpace Sequence Hub para permitir el análisis y la supervisión remota de los
datos (hace falta una hoja de muestras).
3 Introduzca sus credenciales de BaseSpace Sequence Hub (dirección de correo electrónico y
contraseña) y, a continuación, seleccione Sign In (Iniciar sesión).
4 Si aparece la lista Available Workgroups (Grupos de trabajo disponibles), seleccione un grupo de trabajo
para cargar los datos del experimento.
La lista aparece cuando el usuario pertenece a varios grupos de trabajo.
5 Seleccione Run Setup (Configuración del experimento).
Introducir parámetros del experimento
1 En el campo Run Name (Nombre del experimento), introduzca el nombre exclusivo que prefiera para
identificar el experimento actual.
El nombre de experimento puede contener caracteres alfanuméricos, guiones y guiones bajos.
2 En Read Type (Tipo de lectura), seleccione una de las siguientes opciones:
Single Read (Lectura única): Realice una lectura de secuenciación, que es la opción más sencilla y
u
rápida.
Paired-End: Realice dos lecturas de secuenciación, lo que genera datos de mayor calidad y le
u
ofrece una alineación más precisa.
3 En Read Cycle (Ciclo de lectura), introduzca el número de ciclos que realizar en cada lectura.
En Read 1 (Lectura 1) y Read 2 (Lectura 2), añada un ciclo al número de ciclos deseado.
u
En el caso de un experimento solo de PhiX, introduzca 0 en ambos campos de índice.
u
Lectura
Lectura 1
Índice 1
Índice 2
Lectura 2
Normalmente el valor de Read 2 (Lectura 2) es el mismo que en Read 1 (Lectura 1), incluido el ciclo
adicional. Index 1 (Índice 1) secuencia el adaptador de índice i7 e Index 2 (Índice 2) secuencia el
adaptador de índice i5.
4 Para especificar la carpeta de resultados para el experimento actual o cargar una hoja de muestras,
seleccione Advanced (Avanzado):
N.º de documento 1000000036024 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Número de ciclos
26 - 151
Hasta 10
Hasta 10
26 - 151
31