Puntuación De Calidad - Illumina iSeq 100 Manual De Uso

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Guía del sistema de secuenciación iSeq 100
Asegúrese de que al menos una secuencia del adaptador de índice en un grupo de bibliotecas no comienza
con dos bases G. Seleccione las secuencias de adaptadores de índice equilibradas, de manera que la señal
esté presente al menos en una imagen (preferiblemente en ambas imágenes) para cada ciclo. La disposición
de placas y las secuencias que se proporcionan en IDT para índices UD TruSeq de Illumina están diseñadas
para contar con el equilibrio adecuado.
Para obtener más información sobre la indexación y la agrupación, consulte la Guía de agrupación de
adaptadores indexados (n.º de documento 1000000041074).
Puntuación de calidad
Una puntuación de calidad, o puntuación Q, es una predicción de la probabilidad de obtener una llamada
de bases incorrecta. Una puntuación Q superior implica que la llamada de bases tiene una calidad mayor y
es más probable que sea correcta.
La puntuación Q es una forma concisa de comunicar probabilidades de error pequeñas. Q(X) representa
puntuaciones de calidad, donde X es la puntuación. En la siguiente tabla, figura la relación entre la
puntuación de calidad y la probabilidad de error.
Puntuación Q, Q(X)
Probabilidad de error
Q40
0,0001 (1 entre 10 000)
Q30
0,001 (1 entre 1000)
Q20
0,01 (1 entre 100)
Q10
0,1 (1 entre 10)
NOTA
La puntuación de calidad se basa en una versión modificada del algoritmo Phred.
Para la puntuación de calidad, se calcula un conjunto de predictores para cada llamada de bases y, a
continuación, se utilizan los valores de los predictores para determinar la puntuación Q en la tabla de
calidad. Las tablas de calidad se crean para proporcionar predicciones de calidad con una precisión óptima
de experimentos generados mediante una configuración específica de la plataforma de secuenciación y una
versión de composición química concreta.
Tras determinar la puntuación Q, los resultados se registran en archivos de llamada de bases.
N.º de documento 1000000036024 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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