Grupos Que Superan El Filtro; Lecturas De Índices - Illumina iSeq 100 Manual De Uso

Guía del sistema de secuenciación iSeq 100
Figura 10 Visualización de intensidades de grupos
Tabla 3 Llamadas de bases en secuenciación con un solo colorante
Colorante en la
Base
primera imagen
T Presencia
A Presencia
C Ausencia
G Ausencia

Grupos que superan el filtro

Durante el experimento, RTA2 filtra incidencias para eliminar las lecturas que no satisfagan el umbral de
calidad de los datos. Los grupos que se solapan o de baja calidad se eliminan.
En el caso de una secuenciación de un colorante, RTA2 utiliza un sistema basado en la población para
determinar la castidad (medición de pureza de la intensidad) de una llamada de bases. Los grupos que
superan el filtro (PF) cuando solo una llamada de bases de los primeros 25 ciclos tiene un valor de castidad
inferior al umbral fijado.
La alineación de PhiX se lleva a cabo en el ciclo 26 en un subconjunto de placas de grupos que superan el
filtro. Los grupos que no superan el filtro no se alinean ni se realiza en ellos la llamada de bases.
Lecturas de índices
El proceso de llamada de bases de las lecturas de índice difiere del de llamada de bases de las lecturas de
secuenciación. Los primeros dos ciclos de una lectura del índice no se pueden iniciar con dos bases G; de
hacerlo, no se generaría intensidad. Para garantizar el rendimiento de desmultiplexado, debe haber
intensidad en uno de los dos primeros ciclos.
N.º de documento 1000000036024 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación.
Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Colorante en la
Conclusión de imágenes comparadas
segunda imagen
Presencia Los grupos que presentan intensidad en ambas
imágenes son bases T.
Ausencia Los grupos que presentan intensidad solo en la primera
imagen son bases A.
Presencia Los grupos que presentan intensidad solo en la segunda
imagen son bases C.
Ausencia Los grupos que no presentan intensidad en ninguna
imagen son bases G.
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