Protección De Fosfatos (Permanente) - General Electric ÄKTA oligopilot plus Instrucciones De Funcionamiento

Protección de amiditas en ARN
Para la protección de amiditas en ARN suelen utilizarse los grupos de protección rápida
de la siguiente tabla.
Base
A
C
G
U
Además, las amiditas en ARN cuentan con un grupo t-butildimetilsilil (TBDMS) en el hidro-
xilo 2' del azúcar.
Desprotección de fosforamiditas
La desprotección de los grupos protectores de aminas de las fosforamiditas precisa el
tratamiento con hidróxido de amonio concentrado durante una noche a 55-60 ºC.
Protección de fosfatos
(permanente)
Existen varias alternativas para proteger el grupo fosfito hidroxilo, de acuerdo con el
método de acoplamiento empleado en la generación de oligonucleótidos.
El método utilizado en ÄKTA oligopilot plus consiste en proteger el grupo hidroxilo con
un grupo ß-cianoetilo. Así se evita la alquilación de la timina durante la síntesis, que
podría producirse de emplear un grupo de protección metilo.
ÄKTA oligopilot plus Instrucciones de funcionamiento 28959748 AE
Protección
Fenoxiacetilo (PAC)
Acetilo (Ac)
Isopropilfenoxiacetilo (ipr-PAC)
Ninguno
C Química de síntesis de oligonucleótidos
C.2 Química de protección
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