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H Bloques de método en ÄKTA oligopilot plus
Bloque de método
----- Block : DNA_parameters
-----
0.00 Base Time
0.00 Eq_Amidite
(1.50)#Eq_Amidite_DNA {Eq}
0.00 %_Activator (60)#Per-
cent_Activator_DNA {%}
0.00 Amidite_Conc
(0.1)#Conc_Amidite_DNA {M}
0.00 End_block
228
Descripción
Este bloque contiene variables que definen el núme-
ro de equivalentes de amidita, la cantidad de activa-
dor y la concentración de amidita.
Base Time define el tiempo como base de pro-
•
gramación.
Eq_Amidite contiene la variable #Eq_Amidi-
•
te_DNA, que determina el número de equivalen-
tes de amidita que deben utilizarse durante el
acoplamiento.
Se utilizan 1,5 equivalentes de amidita si el
•
-
volumen de columna es igual o superior a
6,3 mL.
Se utilizan 3 equivalentes de amidita si el
-
volumen de columna es 1,2 mL.
Se utilizan 10 equivalentes de amidita para
-
el cartucho pequeño.
%Activator contiene la variable #Percent_Acti-
•
vator_DNA {%}, que determina la cantidad de
activador, en porcentaje, del volumen de acopla-
miento que debe mezclarse con la amidita para
obtener la reacción de acoplamiento. En este
caso se trata de un volumen del 60 %, válido
para todas las amiditas estándar. Puede que
determinados activadores y tipos de amidita
requieran algún ajuste.
AmiditeConc contiene la variable #Conc_Ami-
•
dite_DNA {M}, que tiene en cuenta la concentra-
ción de la solución de amidita.
ÄKTA oligopilot plus 10 suele utilizar 100 mM.
-
ÄKTA oligopilot plus 100 suele utilizar de 0,1
-
a 0,15 M con la columna de 6,3 mL. Si traba-
ja con la columna FineLINE 35 oligo, debe
utilizar 0,2 M.
La combinación de variables de este bloque y los
parámetros de inicio son la base que utiliza el orde-
nador para calcular la cantidad adecuada de ami-
dita y de activador que se emplea en cada reacción
de acoplamiento.
ÄKTA oligopilot plus Instrucciones de funcionamiento 28959748 AE
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