Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Requisitos de [Sequencing_Settings] (Configuración de secuenciación)
Utilice la sección [Sequencing_Settings] (Configuración de secuenciación) para especificar el kit de
preparación de bibliotecas que está usando.
Campo
Necesario
LibraryPrepKits
Requisitos de BCL Convert (Conversión de BCL)
Las secciones BCL Convert (Conversión de BCL) ofrecen información para convertir los datos de BCL a
FASTQ. Las opciones de BCL Convert (Conversión de BCL) incluyen dos secciones independientes:
[BCLConvert_Settings] y [BCLConvert_Data]. Las secciones BCL Convert (Conversión de BCL)
requieren información sobre las secuencias del adaptador de índices. Para identificar la secuencia del
adaptador compatible para cada lectura e índice, consulte Secuencias de adaptadores de Illumina (n.º
de documento 1000000002694).
Estos son los campos y descripciones de [BCLConvert_Settings] disponibles.
Campo
SoftwareVersion
BarcodeMistmatchesIndex1
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
No
Su kit de preparación de bibliotecas. Solo se permite un kit de
preparación de bibliotecas.
En el caso de usar NextSeq 1000/2000 Control Software v1.3 o
posterior, la fórmula personalizada necesaria se selecciona
automáticamente si el kit Stranded Total RNA Prep con Ribo-
Zero Plus o el kit Illumina Stranded mRNA Prep se especifica
como kit de preparación de bibliotecas.
Introduzca uno de los valores siguientes.
•
Kit Illumina Stranded Total RNA Prep con Ribo-Zero Plus:
ILMNStrandedTotalRNA
•
Kit Illumina Stranded mRNA Prep: ILMNStrandedmRNA
Necesario
Sí
No
Descripción
La versión del software DRAGEN instalada
actualmente en el sistema. Utilice los tres números
enteros incluidos en el nombre de la versión. Por
ejemplo, 3.5.7.
El número de incoherencias permitidas entre la primera
lectura del índice y la secuencia de índice. Los valores
pueden ser 0, 1 o 2. El valor predeterminado es 1.
100