Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 121

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
RnaGeneAnnotationFile
BarcodeRead
BarcodePosition
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
No El archivo que contiene anotaciones genéticas
de ARN. Solo se permiten caracteres
alfanuméricos. Si no se suministra, se utiliza el
archivo de anotaciones predeterminado incluido
en el genoma de referencia especificado.
No La ubicación dentro del experimento de
secuenciación del código de barras leído, que
contiene tanto el código de barras como los UMI.
Los valores pueden contener Read1 (Lectura 1) o
Read2 (Lectura 2). El valor predeterminado es
Read1 (Lectura 1).
Sí La ubicación de las bases que corresponden a
los códigos de barras en el valor introducido para
BarcodeRead. Las posiciones de las bases se
indexan empezando por la posición cero.
Introduzca el valor BarcodePosition en el
siguiente formato:
0_<primera posición final del código
de barras>+<segunda posición de inicio
del código de barras>_<segunda
posición final del código de
barras>+<tercera posición de inicio
del código de barras>_<tercera
posición final del código de barras>
Por ejemplo, la estructura siguiente daría lugar a
un valor 0_8+21_29+43_51:
• 9 bases en el primer código de barras (0_8).
• 12 bases entre el primer y el segundo código
de barras.
• 9 bases en el segundo código de barras
(21_29).
• 13 bases entre el segundo y el tercer código de
barras.
• 9 bases en el tercer código de barras (43_51).
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