Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 83

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Componente
Cuantificación de
transcripción
Expresión diferencial
Los siguientes archivos se emiten cuando se habilita la expresión diferencial.
Nombre de archivo
Control_vs_Comparison.differential_
expression_metrics.csv
Control_vs_
Comparison.genes.counts.csv
Control_vs_
Comparison.genes.heatmap.png
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Nombre del archivo de
Tipo
resultados
Texto sin • nombre_
formato muestra.quant.genes.sf
• nombre_
muestra.quant.sf
PNG Consulte la siguiente tabla
de archivos de salida de
expresión diferencial.
Descripción
Contiene mediciones de análisis de expresión
diferencial.
Describe el número de lecturas mapeadas por cada
gen para cada muestra en los grupos de control y
comparación.
Un mapa de calor de la expresión de los genes
expresados diferencialmente para las muestras en los
grupos de control y comparación. El mapa de valor
muestra únicamente genes expresados
diferencialmente con un valor de P ajustado <- 0,05.
En caso de haber más de 30 genes expresados
diferencialmente, solo se usan los 30 mejores genes
expresados diferencialmente. Si DESeq1 no converge
o si no hay genes expresados diferencialmente, el
archivo no se genera.
Descripción
• Resultados de
cuantificación de
transcripción a nivel
de los genes.
• Todos los resultados
de cuantificación de
transcripción.
Para generar archivos
de salida, debe
establecerse una
comparación en la hoja
de muestras.
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