Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 88

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
de índices por carril que no se identificaron en la hoja de muestras según el número de incoherencias
permitidas. Si hay varios valores de índice situados como la entrada más alta de recuento de índices en
el número 100, todos los valores de índice con el mismo recuento se generan como la entrada número
100.
Se incluye la siguiente información:
Criterio
de Descripción
medición
Lane El carril de la celda de flujo donde se ha secuenciado la muestra.
index La secuencia de cada índice desconocido en la Lectura 1 del índice. El campo está
vacío si no se encuentran índices desconocidos.
index2 La secuencia de cada índice desconocido en la Lectura 2 del índice. El campo está
vacío si el experimento es de lectura individual o no se encuentran índices
desconocidos.
# Reads El número de lecturas de la muestra del carril especificado.
Informes de control de calidad de DRAGEN de Illumina
DRAGEN FastQC genera gráficos de control de calidad (CC) de forma predeterminada para todos los
procesos. El conjunto de resultados de CC se guardan en la carpeta AggregatedFastqcMetrics y los
resultados por muestra se guardan en la carpeta <nombre_de_muestra>.
Los informes de CC no se generan si el número de muestras es mayor que 512.
Se proporcionan los gráficos de CC siguientes.
Gráfico de CC
adapter_content
positional_mean_quality
gc_content
positional_quality.read_1
gc_quality
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción
El porcentaje de secuencias para cada par de bases.
Promedio de la puntuación de calidad de la base en la escala
Phred para cada posición leída.
El contenido porcentual en GC para cada lectura de
secuenciación.
Valor promedio de calidad en la escala Phred de bases con un
nucleótido específico y en una ubicación determinada en la
Lectura 1.
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