Requisitos Del Proceso Dragen Enrichment - Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario

Sistema de secuenciación
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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
Sample_ID
Comparison<N>

Requisitos del proceso DRAGEN Enrichment

Estos son los campos y descripciones de [DragenEnrichment_Settings] disponibles.
Campo
SoftwareVersion
ReferenceGenomeDir
BedFile
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario
Descripción
ID de la muestra. El ID de muestra puede
contener un máximo de 20 caracteres
alfanuméricos. El ID distingue entre mayúsculas
y minúsculas. Separe cada identificador con un
guion. Por ejemplo, Muestra1-DQB1-022515. Los
ID de muestra deben coincidir con los ID
especificados en la sección BCLConvert_Data.
No
El valor de control o comparación para cada
muestra. En caso de que no haya ningún valor de
control o comparación para la muestra, a la
muestra se le asigna na. Todas las muestras
marcadas con control se comparan con todas las
muestras marcadas con comparación. El valor de
N refleja el grupo de comparación de las
muestras.
Necesario
Descripción
La versión del software DRAGEN instalada
actualmente en el sistema. Utilice los tres
números enteros incluidos en el nombre de la
versión. Por ejemplo, 3.5.7.
La versión del software debe coincidir con la
versión especificada en la sección BCLConvert_
Settings.
El nombre del genoma de referencia. Por
ejemplo, hg38_alt_aware. Los genomas de
referencia se encuentran en
/usr/local/illumina/genomes. Para utilizar
un genoma de referencia personalizado,
consulte la Ayuda en línea de la aplicación
Reference Builder para Illumina Instruments
v1.0.0.
El archivo *.bed que contiene las regiones a las
que se dirigirá.
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Este manual también es adecuado para:

Nextseq 2000

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