Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Modo Cloud (Nube) o Hybrid (Híbrido): seleccione Upload Custom File (BaseSpace) (Cargar
•
archivo personalizado [BaseSpace]). El archivo BED personalizado solo está disponible en
el grupo de trabajo en el que se ha cargado.
Modo Local: seleccione Select Custom File (Local) (Seleccionar archivo personalizado
•
[Local]) para cargar un único experimento o Upload Custom File (BaseSpace) (Cargar
archivo personalizado [BaseSpace]) para un uso repetido.
3.
Seleccione el llamador de variantes germinales o somáticas.
4.
Seleccione su formato de resultados de asignación o alineación.
5.
[Local]
Seleccione si quiere guardar una copia de sus archivos FASTQ. Los archivos FASTQ solo se
generan si selecciona la opción de conservarlos.
6.
Seleccione si quiere guardar una copia de sus archivos FASTQ. Los archivos FASTQ solo se
generan si selecciona la opción de conservarlos.
7.
Seleccione una de las opciones de formato de salida FASTQ siguientes:
•
gzip: guarda los archivos FASTQ en formato gzip.
•
DRAGEN: guarda los archivos FASTQ en formato ora.
8.
Finalice la configuración del experimento.
•
Para enviar la configuración del experimento a su cuenta de BaseSpace Sequence Hub,
seleccione Submit Run (Enviar experimento). Los experimentos enviados a BaseSpace
Sequence Hub aparecen en la lista de experimentos planificados y están disponibles para
los sistemas utilizando el modo Cloud (Nube) o el modo Hybrid (Híbrido).
[Local]
Para guardar la configuración del experimento como una hoja de muestras con
•
formato de archivo v2, seleccione Export Sample Sheet (Exportar hoja de muestras) en la
lista desplegable Submit Run (Enviar experimento). La hoja de muestras y los archivos de
soporte del análisis secundario se descargan en una carpeta *.zip y son necesarios para
iniciar experimentos en sistemas que utilizan el modo Local. Esta opción solo está
disponible si la ubicación del análisis seleccionada es Local.
Descongelación del cartucho en la bolsa y la celda de
flujo
Este paso descongela el cartucho en la bolsa sin abrir y se prepara la celda de flujo. Descongele el
cartucho dentro de la bolsa utilizando uno de estos tres métodos: en baños de agua controlados, en
refrigerador o a temperatura ambiente. Utilice el cartucho inmediatamente tras descongelarlo, sin
volver a congelarlo. Si no puede usar el cartucho de inmediato después de descongelarlo, consulte
Devolución de los consumibles a almacenamiento en
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
la página 93.
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