Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 112

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
ReferenceGenomeDir
MapAlignOutFormat
KeepFastq
Estos son los campos y descripciones de [DragenGermline_Data] disponibles.
Campo
Sample_ID
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
Sí El nombre del genoma de referencia. Por
ejemplo, hg19_alt_aware. Utilice el nombre del
genoma de referencia de
/usr/local/illumina/genomes. Para utilizar
un genoma de referencia personalizado,
consulte la Ayuda en línea de la aplicación
Reference Builder para Illumina Instruments
v1.0.0.
No El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica
ningún valor, no hay ningún valor
predeterminado.
No Para guardar archivos de resultados FASTQ,
escriba true (verdadero). Para eliminar archivos
de resultados FASTQ, escriba false (falso).
Necesario Descripción
Sí ID de la muestra. El ID de muestra puede
contener un máximo de 20 caracteres
alfanuméricos. El ID distingue entre mayúsculas
y minúsculas. Separe cada identificador con un
guion. Por ejemplo, Muestra1-DQB1-022515. Los
ID de muestra deben coincidir con los ID
especificados en la sección BCLConvert_Data.
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