Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 119

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
BarcodePosition
UmiPosition
BarcodeSequenceWhitelist
KeepFastq
MapAlignOutFormat
Estos son los campos y descripciones de [DragenSingleCellRNA_Data] disponibles.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
Sí La ubicación de las bases que corresponden al
código de barras en el valor introducido para
BarcodeRead. Las posiciones de las bases se
indexan empezando por la posición cero.
Introduzca el valor BarcodePosition en el
siguiente formato:
0_<posición final del código de
barras>
Por ejemplo, si un código de barras contiene
16 bases, el valor es 0_15.
Sí La ubicación de las bases que corresponden al
UMI en el valor introducido para BarcodeRead.
Introduzca el valor UmiPosition en el siguiente
formato:
<Posición de inicio de UMI>_<posición
final de UMI>
Por ejemplo, si el UMI contiene 10 bases y el
código de barras contiene 16, el valor es 16_25.
No El nombre del archivo que contiene las
secuencias del código de barras para incluir.
El nombre del archivo solo puede contener
caracteres alfanuméricos, guiones, guiones
bajos y puntos.
No Para guardar archivos de resultados FASTQ,
escriba true (verdadero). Para eliminar archivos
de resultados FASTQ, escriba false (falso).
No El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica
ningún valor, no hay ningún valor
predeterminado.
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