Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
media (aprox. Q20) y alta (> Q30) y se les asignan puntuaciones específicas de 12, 23 y 37,
respectivamente. Además, se asigna una puntuación nula de 2 en caso de ausencia de llamadas. El
modelo de elaboración de informes de puntuaciones de calidad (puntuaciones Q) reduce los requisitos
de espacio de almacenamiento y ancho de banda sin detrimento de la precisión o el rendimiento.
Figura 7 Puntuación Q simplificada con RTA3
Archivos de resultados de secuenciación
Tipo de archivo
Archivos de
llamadas de bases
concatenadas
Archivos de
ubicación de grupos
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Descripción, ubicación y nombre del archivo
Cada grupo analizado se incluye en un archivo de llamadas de bases
concatenadas, agregado en un archivo para cada ciclo, carril y superficie.
El archivo agregado contiene la llamada de bases concatenada y la
puntuación de calidad codificada para cada grupo. Los archivos de llamadas
de bases concatenadas los utilizan BaseSpace Sequence Hub o bcl2fastq2.
Datos/Intensidades/LlamadaBases/L001/C1.1
L[carril]_[superficie].cbcl, por ejemplo L001_1.cbcl
Para cada celda de flujo, un archivo binario de ubicación de grupos contiene
las coordenadas X e Y para los grupos en una placa. Una disposición
hexagonal que coincide con la disposición de nanopocillos de la celda de flujo
define previamente las coordenadas.
Datos/Intensidades
s_[carril].locs
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