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Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
ubicación de grupos (s.locs) para cada experimento.
Si se produce un error en el registro de cualquier imagen en un ciclo, no se generará ninguna llamada
de bases para esa placa en ese ciclo. Utilice el Visor del análisis de secuenciación para identificar qué
imágenes no se han podido registrar.
Extracción de intensidad
Tras el registro, la extracción de intensidad calcula un valor de intensidad para cada nanopocillo en una
imagen determinada. Si el registro falla, no es posible extraer la intensidad para dicha placa.
Corrección de hebra retrasada
Durante la reacción de secuenciación, cada cadena de ADN de un grupo se amplía en una base por
cada ciclo. Las hebras retrasadas y hebras adelantadas se producen cuando una cadena queda fuera
de su lugar con respecto al ciclo de incorporación actual.
La hebra retrasada se produce cuando una base se atrasa.
La hebra adelantada se produce cuando una base se adelanta.
Figura 5 Hebra retrasada y hebra adelantada
A. Lectura con una base con hebra retrasada
B. Lectura con una base con hebra adelantada
RTA3 corrige los efectos de la hebra retrasada y adelantada, lo que aumenta al máximo la calidad de
los datos en cada uno de los ciclos del experimento.
Llamada de bases
La llamada de bases determina una base (A, C, G o T) para cada grupo de una placa determinada en un
ciclo específico. Los sistemas de secuenciación NextSeq 1000 y NextSeq 2000 utilizan secuenciación
de dos canales, que precisa solo dos imágenes para codificar los datos de cuatro bases de ADN, una
del canal verde y una del canal azul.
Una ausencia de llamada se identifica como N. La ausencia de llamadas se produce cuando un grupo
no supera el filtro, el registro falla o se desplaza un grupo fuera de la imagen.
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
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Solución de problemas
