Illumina NextSeq 1000 Guia Del Usuario página 115

Guía del sistema de secuenciación NextSeq 1000 y 2000
Campo
GermlineOrSomatic
KeepFastq
MapAlignOutFormat
AuxNoiseBaselineFile
Estos son los campos y descripciones de [DragenEnrichment_Data] disponibles.
Campo
Sample_ID
N.º de documento 1000000109376 v05 ESP
Para uso exclusivo en investigación. Prohibido su uso en procedimientos de diagnóstico.
Necesario Descripción
Sí Para realizar un análisis de enriquecimiento
germinal, escriba germline. Para realizar un
análisis de enriquecimiento somático, escriba
somatic.
No Para guardar archivos de resultados FASTQ,
escriba true (verdadero). Para eliminar archivos
de resultados FASTQ, escriba false (falso).
No El formato del archivo de resultados. Los valores
permitidos son bam o cram. Si no se especifica
ningún valor, no hay ningún valor
predeterminado.
No El nombre del archivo de referencia de ruido.
Puede emplear el formato de archivo *.txt o *.gz.
Los archivos de referencia de ruido solo están
disponibles durante el modo somático. Consulte
Import Noise Baseline Files (Importar archivos de
referencia de ruido) en la página 19
más información.
Necesario Descripción
Sí ID de la muestra. El ID de muestra puede
contener un máximo de 20 caracteres
alfanuméricos. El ID distingue entre mayúsculas
y minúsculas. Separe cada identificador con un
guion. Por ejemplo, Muestra1-DQB1-022515. Los
ID de muestra deben coincidir con los ID
especificados en la sección BCLConvert_Data.
para obtener
106